此次M503航路的双向开通，标志着中国民航在保障航班正常性方面又迈出的坚实一步。
但是，台湾民航管理部门却不这么认为，称此举危及台湾“飞航、空防安全”。同时，中国台湾“陆委会”也因“此次开通航线并未经过两岸协商并提出严正抗议”。
其实，关于M503航路的争议在10年前就有。
早在2007年，中国大陆就表示将在海峡中线西侧划设新航路，但由于种种原因，当时并未公布具体的航路设置。
时至2015年初，中国再度公布航路，引起了一定争议。
2015年
1月12日：中国大陆方面公布M503预定在3月5日生效
1月12日：中国大陆方面公布M503预定在3月5日生效
1月13日：中国台湾当局民航管理部门提出抗议
1月16日：中国台湾立法机构要求证府提出抗议
1月17日：中国大陆表示已透过小两会就技术性问题沟通
2月5日：中国台湾“陆委会”宣布沟通未达共识，原定2月7日金门王张会延期
3月2日：小两会达成共识，M503暂缓生效，而其余3条航路不启用
3月4日：中国大陆将航线西移6海里并延后启用
3月29日，中国大陆宣布启用航线，港龙航空首次使用这条航线，由上海飞往香港。时至2018年1月3日，M503航线使用者主要由东北往西南方向的国际航班。
（台湾媒体制作的M503事件图）
M503有什么“威胁”？
《自由时报》4日报道称，此航线离海峡中线仅有4.2海里(约7.8公里)，台“民航局”因此担忧，开启后恐危及台湾往返金门、马祖的飞航安全，“台湾空防更可能受到冲击”。
其实，这条M503航线在马英九时期就已规划。2015年，在两岸关袭斝认“九二共识”的融洽氛围下，经过双方的反复协商，在M503航线飞行时，向中国大陆方向西移6海里，并只开通了该航线由北向南的飞行，三条支线和由南向北的航线暂不开通。
现在，由于海峡西岸空域航线流量压力的增加，大陆方面开始启动M503由南向北的飞行航线，同时补上3条连接线，这是正常缓解航班拥堵情况的需要。
