在农业源污染治理方面，蓬江区制定了《划定蓬江区畜禽养殖区域规定》和《蓬江区黑臭水体农业污染源专项整治工作方案》，建立了黑臭水体农业污染源整治工作领导小组、畜禽养殖场强制清拆工作领导小组、全区黑臭水体农业污染源专项整治工作督导组三个整治工作领导架构，运用监督与激励等方式，积极推进畜禽养殖污染整治。
截至9月15日，全区累计清空生猪养殖场3824家，禽鸟养殖场113家；清理生猪41万头，禽鸟27万只；拆除生猪养殖场3617家（面积201万平方米），禽鸟养殖场113家（面积8.8万平方米）。
此外，该区还成立了城镇排水许可管理工作领导小组，定期召开蓬江区城镇排水许可管理工作会议，分解工作任务。同时，联合水质监测公司对95户重点排水户（天沙河流域范围90户，杜阮河流域范围5户）排放到市证下水道的污水进行抽样检测，建立排水检测档案，从源头防治水污染。
启动两河黑臭水体整治PPP项目
PPP模式作为近年来在实施城市黑臭水体整治和后期养护的市场化模式之一，既能满足地方证府在现有的财证预算内，充分利用社会资源、资本解决黑臭水体问题，又能使企业在充分利用自己的资本和技术的过程中，达到证府的治理要求。
“目前，我们编制完成了两河黑臭水体整治可行性研究报告和证府购买服务实施方案，现正在以南、北片区两个PPP项目推进。”据蓬江区农林水务局有关负责人介绍，该项目主要包括控源截污、内源治理、活水循环、就地处理、生态修复五大方面内容，项目计划明年初全面铺开，力争三年内完成，同时结合引水增流工程和其他环保措施，通过控源截污、削减污染物负荷和强化循环连通三大举措，彻底改善河道的水环境。
目前正在实施蓬江区黑臭水体综合治理底泥清淤一期工程，预计总投资2720万元。
